Este programa mundial aconteceu pela primeira vez em 1997, em França, mas foi em 2005, na Alemanha, que ganhou o nome e se tornou num encontro oficial, que se veio a repetir nos anos seguintes. Alguns anos depois, em 2011, em Espanha, contou com a presença de milhares de participantes vindos de 50 países diferentes e foi nesse ano que adquiriu a sua forma atual.
Sendo Portugal o país anfitrião do MAGIS, a imagem do encontro reflecte a bandeira portuguesa com as suas quinas, que representam Portugal e remetem para as chagas de Cristo; o azul evoca o mar português, tão querido à memória coletiva, e coloca o MAGIS e os seus peregrinos sob o manto de Nossa Senhora, Rainha de Portugal e Mãe da Companhia de Jesus. As ondas dos A – que se destacam no logo – remetem para o imaginário português e jesuíta da abertura a novos mares e horizontes, de diálogo entre culturas e tradições, da curiosidade do encontro, da alegria das vidas partilhadas.